| Universidad Autonoma del Estado de MorelosCuernavaca · Public | 27,820 | 4,383 | 4,395 | 42 |
| Instituto Tecnologico de ZacatepecZacatepec · Public | 4,945 | 950 | 420 | 1 |
| Universidad Tecnologica Emiliano Zapata del Estado de MorelosEmiliano Zapata · Public | 3,899 | 1,506 | 1,434 | 1 |
| Instituto Tecnologico de CuautlaCuautla · Public | 3,310 | 249 | 303 | 1 |
| Centro de Estudios Universitarios CucepCuautla · Private | 3,025 | 1,048 | 1,048 | 1 |
| Universidad Politecnica del Estado de MorelosJiutepec · Public | 2,967 | 616 | 422 | 1 |
| Instituto de Competencias Educativas y ProfesionalesCuautla · Private | 2,221 | 599 | 599 | 1 |
| Centro Universitario AztlanCuautla · Private | 1,833 | 407 | 348 | 3 |
| Universidad de Investigación E Innovación de MéxicoJiutepec · Private | 1,641 | 137 | 2 | 1 |
| Universidad del Valle de CuernavacaCuernavaca · Private | 1,361 | 292 | 195 | 1 |
| Universidad la Salle CuernavacaCuernavaca · Private | 1,308 | 351 | 196 | 6 |
| Universidad Pedagogica NacionalAyala · Public | 1,238 | 187 | 185 | 3 |
| Colegio JuristaCuernavaca · Private | 1,123 | 287 | 53 | 2 |
| Universidad Mexicana de Educacion a DistanciaCuernavaca · Private | 1,075 | 238 | 147 | 1 |
| Universidad LatinaCuernavaca · Private | 1,041 | 217 | 199 | 2 |
| Universidad InternacionalCuernavaca · Private | 997 | 285 | 138 | 1 |
| Instituto Azteca de Formacion EmpresarialCuautla · Private | 913 | 125 | 125 | 2 |
| Esef CuautlaCuautla · Private | 849 | 151 | 158 | 1 |
| Universidad Latinoamericana Campus CuernavacaCuernavaca · Private | 829 | 136 | 150 | 1 |
| Universidad del Valle de Mexico Campus CuernavacaTemixco · Private | 792 | 81 | 65 | 1 |
| Universidad Mesoamericana Campus MorelosCuernavaca · Private | 781 | 137 | 83 | 1 |
| Escuela de Enfermeria Florencia Nightingale Cruz Roja Delegacion CuernavacaCuernavaca · Private | 766 | 128 | 84 | 2 |
| Centro Educativo Morelense Plantel CentroCuernavaca · Private | 640 | 89 | 61 | 2 |
| Universidad Tecnologica del Sur del Estado de MorelosPuente de Ixtla · Public | 636 | 264 | 254 | 1 |
| Centro de Estudios Superiores de AmericaCuautla · Private | 484 | 190 | 190 | 1 |
| El Colegio de MorelosCuernavaca · Public | 458 | 30 | 17 | 1 |
| Instituto Universitario UnigesCuautla · Private | 452 | 103 | 0 | 1 |
| Centro Universitario Interamericano Plantel CuautlaCuautla · Private | 437 | 29 | 35 | 1 |
| Instituto Nacional de Salud PublicaCuernavaca · Public | 435 | 164 | 156 | 1 |
| Escuela Normal Urbana Federal de CuautlaCuautla · Public | 427 | 96 | 85 | 1 |
| Instituto Universitario DarwinCuernavaca · Private | 427 | 34 | 0 | 1 |
| Instituto Tecnologico y de Estudios Superiores de Monterrey Campus MorelosXochitepec · Private | 420 | 102 | 99 | 1 |
| Escuela de Derecho Posgrados y Practica JuridicaCuernavaca · Private | 414 | 163 | 110 | 1 |
| Centro Educativo en Estudios SuperioresCuautla · Private | 381 | 93 | 0 | 1 |
| Universidad Nacional Autónoma de MéxicoCuernavaca · Public | 381 | 150 | 134 | 5 |
| Centro de Estudios de Posgrado Plantel MorelosCuernavaca · Private | 371 | 0 | 0 | 1 |
| Centro Universitario AlianzaCuautla · Private | 367 | 56 | 41 | 1 |
| Centro Internacional de Estudios Superiores de MorelosCuernavaca · Private | 366 | 180 | 145 | 1 |
| Gral. Emiliano ZapataTemoac · Public | 362 | 66 | 60 | 1 |
| Escuela Superior de CuautlaCuautla · Private | 359 | 106 | 118 | 2 |
| Centro Nacional de Investigacion y Desarrollo Tecnologico (cenidet)Cuernavaca · Public | 356 | 63 | 63 | 1 |
| Lic. Benito JuarezCuernavaca · Private | 353 | 87 | 85 | 1 |
| Universidad Tec MilenioTemixco · Private | 328 | 53 | 53 | 1 |
| Centro Educativo de HumanidadesJiutepec · Private | 323 | 46 | 48 | 1 |
| Instituto de Ciencias JuridicasCuernavaca · Private | 318 | 73 | 95 | 1 |
| Centro Universitario Benjamín FranklinCuautla · Private | 305 | 37 | 0 | 1 |
| Universidad Fray Luca PaccioliCuernavaca · Private | 300 | 54 | 102 | 1 |
| Centro Morelense de las ArtesCuernavaca · Public | 297 | 98 | 56 | 1 |
| Centro Universitario LibertadCuautla · Private | 219 | 34 | 11 | 1 |
| Universidad Loyola de AmericaCuernavaca · Private | 204 | 56 | 63 | 1 |
| Centro Universitario Bonampak Campus CuernavacaCuernavaca · Private | 199 | 67 | 39 | 1 |
| Universidad Icel, Campus CuernavacaCuernavaca · Private | 197 | 65 | 16 | 1 |
| Centro Universitario Central HispanaCuautla · Private | 192 | 90 | 29 | 2 |
| Normal Superior del Estado de MorelosCuernavaca · Private | 189 | 60 | 39 | 1 |
| Universidad CuauhnahuacTemixco · Private | 173 | 47 | 43 | 4 |
| Centro de Estudios Universitarios M. FreedmanTemixco · Private | 156 | 24 | 31 | 1 |
| Centro de Estudios Universitarios MorelosJojutla · Private | 146 | 34 | 19 | 1 |
| Centro Universitario Montes de OcaCuernavaca · Private | 143 | 20 | 30 | 1 |
| Universidad StratfordCuautla · Private | 140 | 38 | 20 | 1 |
| Instituto de Ingenieros de MorelosCuernavaca · Private | 124 | 19 | 0 | 1 |
| Universidad Guizar y ValenciaCuernavaca · Private | 123 | 43 | 41 | 1 |
| Universidad SantanderEmiliano Zapata · Private | 114 | 35 | 0 | 1 |
| Centro Universitario ClickCuernavaca · Private | 110 | 30 | 0 | 1 |
| Universidad Privada del Estado de MorelosCuautla · Private | 109 | 11 | 17 | 2 |
| Centro de Estudios de Posgrado Lic Benito Juarez GarciaCuernavaca · Private | 107 | 88 | 0 | 1 |
| Instituto Frances de Gastronomia IfraCuernavaca · Private | 107 | 11 | 4 | 1 |
| Universidad DoradosYautepec · Private | 107 | 40 | 66 | 1 |
| Centro de Desarrollo de Productos BioticosYautepec · Public | 102 | 12 | 18 | 2 |
| Instituto SapientiaCuernavaca · Private | 102 | 20 | 12 | 1 |
| Centro de Estudios Universitarios International HouseCuernavaca · Private | 100 | 33 | 30 | 1 |