| Universidad Autonoma del Estado de MorelosCuernavaca · Public | 27,721 | 4,182 | 3,921 | 42 |
| Instituto Tecnologico de ZacatepecZacatepec · Public | 5,231 | 954 | 737 | 1 |
| Universidad Tecnologica Emiliano Zapata del Estado de MorelosEmiliano Zapata · Public | 3,620 | 1,693 | 1,650 | 1 |
| Instituto Tecnologico de CuautlaCuautla · Public | 3,232 | 523 | 305 | 1 |
| Universidad Politecnica del Estado de MorelosJiutepec · Public | 3,078 | 541 | 358 | 1 |
| Centro de Estudios Universitarios CucepCuautla · Private | 3,055 | 460 | 460 | 1 |
| Instituto de Competencias Educativas y ProfesionalesCuautla · Private | 1,759 | 305 | 305 | 1 |
| Universidad Latinoamericana Campus CuernavacaCuernavaca · Private | 1,563 | 547 | 286 | 1 |
| Universidad la Salle CuernavacaCuernavaca · Private | 1,386 | 325 | 221 | 6 |
| Universidad Mexicana de Educacion a DistanciaCuernavaca · Private | 1,195 | 310 | 292 | 2 |
| Universidad del Valle de CuernavacaCuernavaca · Private | 1,175 | 282 | 183 | 1 |
| Universidad Pedagogica NacionalAyala · Public | 1,173 | 332 | 244 | 3 |
| Universidad InternacionalCuernavaca · Private | 1,135 | 189 | 53 | 1 |
| Centro Universitario AztlanCuautla · Private | 1,112 | 657 | 368 | 3 |
| Colegio JuristaCuernavaca · Private | 1,015 | 218 | 88 | 2 |
| Universidad LatinaCuernavaca · Private | 992 | 245 | 197 | 2 |
| Universidad Mesoamericana Campus MorelosCuernavaca · Private | 757 | 102 | 159 | 1 |
| Centro Educativo Morelense Plantel CentroCuernavaca · Private | 713 | 190 | 40 | 1 |
| Universidad del Valle de Mexico Campus CuernavacaTemixco · Private | 700 | 123 | 116 | 1 |
| Escuela de Enfermeria Florencia Nightingale Cruz Roja Delegacion CuernavacaCuernavaca · Private | 668 | 131 | 144 | 2 |
| Instituto Universitario DarwinCuernavaca · Private | 645 | 87 | 5 | 1 |
| Universidad Tecnologica del Sur del Estado de MorelosPuente de Ixtla · Public | 580 | 226 | 228 | 1 |
| Esef CuautlaCuautla · Private | 568 | 150 | 91 | 1 |
| Universidad CuauhnahuacTemixco · Private | 482 | 251 | 77 | 4 |
| Instituto Tecnologico y de Estudios Superiores de Monterrey Campus MorelosXochitepec · Private | 435 | 137 | 137 | 1 |
| Universidad Nacional Autónoma de MéxicoCuernavaca · Public | 434 | 129 | 137 | 5 |
| Instituto Azteca de Formacion EmpresarialCuautla · Private | 432 | 55 | 55 | 2 |
| Escuela Superior de CuautlaCuautla · Private | 424 | 148 | 78 | 2 |
| Escuela Normal Urbana Federal de CuautlaCuautla · Public | 399 | 108 | 93 | 1 |
| Instituto Nacional de Salud PublicaCuernavaca · Public | 394 | 162 | 164 | 1 |
| Lic. Benito JuarezCuernavaca · Private | 383 | 90 | 90 | 1 |
| Centro Universitario AlianzaCuautla · Private | 374 | 79 | 31 | 1 |
| Universidad Fray Luca PaccioliCuernavaca · Private | 370 | 142 | 116 | 2 |
| Centro Nacional de Investigacion y Desarrollo Tecnologico (cenidet)Cuernavaca · Public | 365 | 67 | 67 | 1 |
| El Colegio de MorelosCuernavaca · Public | 365 | 60 | 60 | 1 |
| Gral. Emiliano ZapataTemoac · Public | 354 | 72 | 71 | 1 |
| Centro de Estudios Superiores de AmericaCuautla · Private | 347 | 102 | 102 | 1 |
| Universidad Tec MilenioTemixco · Private | 341 | 86 | 86 | 1 |
| Centro Universitario Interamericano Plantel CuautlaCuautla · Private | 313 | 77 | 26 | 1 |
| Universidad de Investigación E Innovación de MéxicoJiutepec · Private | 313 | 10 | 1 | 1 |
| Escuela de Derecho Posgrados y Practica JuridicaCuernavaca · Private | 307 | 164 | 97 | 1 |
| Centro de Estudios Universitarios M. FreedmanTemixco · Private | 299 | 46 | 0 | 1 |
| Centro Morelense de las ArtesCuernavaca · Public | 289 | 109 | 60 | 1 |
| Centro Educativo de HumanidadesJiutepec · Private | 276 | 47 | 31 | 1 |
| Instituto de Ciencias JuridicasCuernavaca · Private | 274 | 101 | 116 | 1 |
| Centro Universitario Benjamín FranklinCuautla · Private | 236 | 58 | 1 | 1 |
| Universidad Icel, Campus CuernavacaCuernavaca · Private | 235 | 41 | 5 | 1 |
| Centro Internacional de Estudios Superiores de MorelosCuernavaca · Private | 226 | 74 | 70 | 1 |
| Centro Educativo en Estudios SuperioresCuautla · Private | 222 | 18 | 0 | 1 |
| Centro Universitario Central HispanaCuautla · Private | 219 | 102 | 32 | 2 |
| Universidad StratfordCuautla · Private | 201 | 52 | 27 | 1 |
| Universidad Loyola de AmericaCuernavaca · Private | 199 | 46 | 47 | 1 |
| Normal Superior del Estado de MorelosCuernavaca · Private | 196 | 52 | 53 | 1 |
| Centro Universitario LibertadCuautla · Private | 194 | 46 | 0 | 1 |
| Centro Universitario Bonampak Campus CuernavacaCuernavaca · Private | 175 | 33 | 49 | 1 |
| Centro de Estudios Universitarios MorelosJojutla · Private | 154 | 57 | 15 | 1 |
| Universidad Guizar y ValenciaCuernavaca · Private | 132 | 53 | 23 | 1 |
| Centro Universitario Montes de OcaCuernavaca · Private | 127 | 18 | 18 | 1 |
| Instituto de Ingenieros de MorelosCuernavaca · Private | 115 | 18 | 0 | 1 |
| Universidad DoradosYautepec · Private | 112 | 74 | 77 | 1 |
| Instituto de Capacitación Odontológico de Morelos (incom)Cuernavaca · Private | 111 | 35 | 0 | 1 |
| Instituto Gestalt de CuernavacaCuernavaca · Private | 111 | 38 | 45 | 1 |
| Centro Universitario ClickCuernavaca · Private | 109 | 25 | 0 | 1 |
| Universidad Privada del Estado de MorelosCuautla · Private | 103 | 24 | 51 | 2 |