| Universidad Autonoma de Baja CaliforniaMexicali · Public | 70,791 | 10,085 | 8,892 | 46 |
| Instituto Tecnologico de TijuanaTijuana · Public | 12,002 | 1,922 | 1,176 | 1 |
| Centro de Enseñanza Tecnica y SuperiorMexicali · Private | 5,399 | 1,337 | 1,307 | 3 |
| Universidad Tecnologica de TijuanaTijuana · Public | 5,248 | 1,867 | 875 | 2 |
| Universidad Autonoma de DurangoMexicali · Private | 4,771 | 578 | 99 | 3 |
| Centro de Estudios Universitarios Vizcaya de las AmericasEnsenada · Private | 3,603 | 921 | 295 | 3 |
| Instituto Tecnologico de EnsenadaEnsenada · Public | 3,518 | 192 | 248 | 1 |
| Instituto Tecnologico de MexicaliMexicali · Public | 3,474 | 584 | 277 | 1 |
| Centro Universitario de TijuanaTijuana · Private | 3,185 | 902 | 546 | 6 |
| Universidad 16 de SeptiembreMexicali · Private | 3,130 | 973 | 175 | 2 |
| Centro de Estudios Universitarios XochicalcoTijuana · Private | 2,896 | 704 | 450 | 1 |
| Centro de Estudios Superiores del NoroesteTijuana · Private | 2,885 | 746 | 195 | 1 |
| Universidad del Desarrollo Profesional S.C.Tijuana · Private | 1,990 | 111 | 18 | 3 |
| Instituto de Posgrado en Ciencias Penales y Politica Criminal de B.c.Tijuana · Private | 1,839 | 720 | 570 | 1 |
| Universidad de Estudios Avanzados TijuanaTijuana · Private | 1,720 | 144 | 176 | 2 |
| Centro de Estudios Universitarios XochicalcoMexicali · Private | 1,455 | 445 | 400 | 1 |
| Centro de Estudios Universitarios XochicalcoEnsenada · Private | 1,429 | 163 | 166 | 2 |
| Universidad Politecnica de Baja CaliforniaMexicali · Public | 1,396 | 204 | 0 | 1 |
| Centro de Estudios Universitarios de MexicaliPlayas de Rosarito · Private | 1,316 | 323 | 35 | 4 |
| Universidad Interamericana para el DesarrolloEnsenada · Private | 1,299 | 147 | 90 | 2 |
| Universidad de las Californias InternacionalTijuana · Private | 1,258 | 300 | 116 | 1 |
| Centro de Enseñanza y Capacitacion de Estudios Superiores de Baja CaliforniaTecate · Private | 1,198 | 506 | 228 | 5 |
| Instituto Educativo Jose VasconcelosTijuana · Private | 980 | 323 | 254 | 1 |
| Unus, Centro de Estudios UniversitariosTijuana · Private | 869 | 105 | 90 | 2 |
| Universidad del Valle de MexicoMexicali · Private | 815 | 56 | 28 | 1 |
| Inide, Instituto Internacional para el Desarrollo EmpresarialTecate · Private | 777 | 198 | 103 | 3 |
| Escuela Normal Fronteriza TijuanaTijuana · Public | 759 | 186 | 172 | 1 |
| Universidad Iberoamericana TijuanaTijuana · Private | 742 | 140 | 172 | 1 |
| Universidad EnsenadaSan Quintín · Private | 660 | 184 | 151 | 2 |
| Centro de Investigacion Cientifica y Educacion Superior de EnsenadaEnsenada · Public | 588 | 159 | 159 | 4 |
| Centro Universitario de Baja CaliforniaTijuana · Private | 553 | 179 | 66 | 2 |
| Centro Universitario del PacificoTijuana · Private | 544 | 119 | 109 | 2 |
| Centro de Estudios Superiores Nueva BajaPlayas de Rosarito · Private | 526 | 44 | 65 | 1 |
| Centro de Estudios Superiores en Ciencias Administrativas CescaTijuana · Private | 515 | 75 | 3 | 4 |
| Instituto Universitario de EnsenadaEnsenada · Private | 420 | 83 | 69 | 2 |
| Universidad Pedagogica Nacional, Unidad 022 TijuanaTijuana · Public | 413 | 124 | 85 | 3 |
| Universitario Tecnologico UniversitamTijuana · Private | 379 | 0 | 0 | 1 |
| Centro de Estudios Superiores de la Frontera (unifront)Tijuana · Private | 373 | 109 | 117 | 1 |
| Centro de Estudios Universitarios de Baja CaliforniaPlayas de Rosarito · Private | 372 | 396 | 396 | 1 |
| Escuela de Enfermeria Florencia NightingaleTijuana · Private | 323 | 45 | 0 | 1 |
| Benemerita Escuela Normal Urbana Federal FronterizaMexicali · Public | 320 | 102 | 90 | 1 |
| Centro de Estudios Superiores, Culinary Art SchoolTijuana · Private | 288 | 60 | 27 | 1 |
| Escuela de Enfermeria del Instituto Mexicano del Seguro SocialTijuana · Public | 258 | 32 | 69 | 1 |
| Escuela Superior de Comercio Exterior, A.C.Mexicali · Private | 240 | 97 | 68 | 2 |
| Centro de Estudios Superiores en Ciencias Penales, A.C.Mexicali · Private | 233 | 91 | 30 | 1 |
| Benemérita Escuela Normal Estatal, Profesor Jesús Prado LunaEnsenada · Public | 225 | 85 | 74 | 1 |
| Escuela Normal Experimental "mtro. Rafael RamirezMexicali · Public | 217 | 52 | 52 | 1 |
| Universidad Intercultural de Baja CaliforniaSan Quintín · Public | 217 | 12 | 13 | 1 |
| El Colegio de la Frontera Norte, A.C.Tijuana · Public | 204 | 150 | 130 | 1 |
| Instituto Superior de Gastronomia y NutricionTijuana · Private | 204 | 58 | 34 | 1 |
| Centro de Enseñanza E Investigación Superior de TijuanaTijuana · Private | 196 | 41 | 44 | 1 |
| Escuela Normal Particular Colegio Ensenada, Ensenada B.c.Ensenada · Private | 193 | 58 | 44 | 1 |
| Instituto de Gastronomia de Baja CaliforniaTijuana · Private | 191 | 53 | 0 | 1 |
| Tecnologico de Baja CaliforniaTijuana · Private | 189 | 45 | 49 | 2 |
| Escuela Normal Estefania Castañeda y Nuñez de CaceresMexicali · Public | 187 | 26 | 21 | 1 |
| Universidad Estatal de Estudios PedagogicosMexicali · Public | 185 | 72 | 72 | 2 |
| Universidad Pedagogica NacionalMexicali · Public | 172 | 56 | 54 | 1 |
| Escuela Normal Experimental Profr. Gregorio Torres QuinteroSan Quintín · Public | 161 | 47 | 47 | 1 |
| Instituto Educativo José Vasconcelos, Campus Patria NuevaTijuana · Private | 148 | 39 | 0 | 1 |
| Benemerita Escuela Normal Urbana Nocturna del Estado Ing. Jose G. ValenzuelaMexicali · Public | 146 | 36 | 36 | 1 |
| Centro Educativo California A.C.Tijuana · Private | 144 | 17 | 0 | 2 |
| Centro Internacional de Estudios Superiores, A.C.Tijuana · Private | 143 | 49 | 53 | 1 |
| Instituto TijuanaTijuana · Private | 132 | 42 | 48 | 1 |
| Escuela Normal Luz Maria ChapelaSan Quintín · Public | 129 | 22 | 22 | 1 |
| Benemérita Escuela Normal Educadora Rosaura ZapataMexicali · Public | 127 | 35 | 38 | 1 |
| Educacion Superior del PacificoTijuana · Private | 127 | 65 | 65 | 1 |
| Escuela Normal del Valle de Mexicali Ejido CampecheMexicali · Public | 121 | 25 | 25 | 1 |
| Instituto Universitario del Centro de MexicoMexicali · Private | 120 | 7 | 7 | 1 |
| Instituto de Estudios de Prevención y Formación InterdisciplinariaTecate · Public | 114 | 55 | 0 | 4 |
| Escuela de Educación Superior Madre TeresaTijuana · Private | 112 | 17 | 19 | 1 |
| Centro de Estudios Superiores del NayarTijuana · Private | 108 | 53 | 0 | 1 |
| Universidad Nacional Autónoma de MéxicoEnsenada · Public | 100 | 30 | 24 | 1 |