| Universidad Autonoma de ChiapasTuxtla Gutiérrez · Public | 29,981 | 3,619 | 2,332 | 39 |
| Universidad de Ciencias y Artes de ChiapasTuxtla Gutiérrez · Public | 9,657 | 1,716 | 1,550 | 27 |
| Universidad Valle del GrijalvaTuxtla Gutiérrez · Private | 7,083 | 2,752 | 1,865 | 4 |
| Instituto Tecnologico de Tuxtla GutierrezTuxtla Gutiérrez · Public | 4,787 | 684 | 721 | 1 |
| Universidad IexproTuxtla Gutiérrez · Private | 4,661 | 3,213 | 47 | 1 |
| Universidad Pablo Guardado ChavezTuxtla Gutiérrez · Private | 3,882 | 726 | 432 | 1 |
| Universidad Tecnológica de la SelvaOcosingo · Public | 3,333 | 1,130 | 1,124 | 4 |
| Universidad Politecnica de ChiapasSuchiapa · Public | 3,109 | 803 | 777 | 1 |
| Instituto Tecnologico de TapachulaTapachula · Public | 2,614 | 397 | 620 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores de Chiapas Plantel TuxtlaTapachula · Private | 2,481 | 622 | 609 | 7 |
| Universidad Intercultural de ChiapasSan Cristóbal de las Casas · Public | 2,361 | 294 | 357 | 5 |
| Instituto de Estudios Superiores de ChiapasTuxtla Gutiérrez · Private | 2,132 | 736 | 409 | 2 |
| Centro de Formacion Profesional de Chiapas MayaTuxtla Gutiérrez · Private | 2,007 | 27 | 152 | 2 |
| Instituto Profesional de EmprendedoresTuxtla Gutiérrez · Private | 1,792 | 604 | 511 | 4 |
| Instituto Superior Universitario Amado NervoTuxtla Gutiérrez · Private | 1,729 | 594 | 576 | 1 |
| Instituto Tecnologico de ComitanComitán de Domínguez · Public | 1,661 | 321 | 324 | 1 |
| Universidad Jose VasconcelosSan Cristóbal de las Casas · Private | 1,357 | 489 | 198 | 1 |
| Universidad del SoconuscoTapachula · Private | 1,318 | 330 | 212 | 4 |
| Universidad del SuresteComitán de Domínguez · Private | 1,277 | 138 | 116 | 5 |
| Universidad del SurTuxtla Gutiérrez · Private | 1,249 | 964 | 440 | 2 |
| Universidad MesoamericanaSan Cristóbal de las Casas · Private | 1,154 | 262 | 266 | 1 |
| Universidad de ChiapasTuxtla Gutiérrez · Private | 1,153 | 690 | 89 | 1 |
| Universidad del TacanaTapachula · Private | 1,087 | 249 | 48 | 1 |
| Instituto Tecnologico Superior de CintalapaCintalapa de Figueroa · Public | 1,071 | 239 | 227 | 1 |
| Centro Universitario Mesoamericano Joaquin Miguel GutierrezTuxtla Gutiérrez · Private | 1,008 | 255 | 173 | 2 |
| Universidad San CristobalTapachula · Private | 999 | 277 | 220 | 4 |
| Universidad Politecnica de TapachulaTapachula · Public | 925 | 199 | 186 | 1 |
| Instituto de Formacion Academica del Centro y SuresteTuxtla Gutiérrez · Private | 826 | 233 | 137 | 2 |
| Universidad CeussTuxtla Gutiérrez · Private | 814 | 483 | 361 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores Sor Juana Ines de la CruzTuxtla Gutiérrez · Private | 810 | 209 | 104 | 4 |
| Universidad Privada del Sur de MexicoTuxtla Gutiérrez · Private | 755 | 180 | 151 | 1 |
| Centro de Formación Universitaria Filantrópica InternacionalTapachula · Private | 751 | 70 | 0 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores del SuresteVillaflores · Private | 746 | 215 | 99 | 1 |
| Escuela Nacional de Protección Civil Campus ChiapasOcozocoautla de Espinosa · Public | 700 | 169 | 134 | 1 |
| Universidad de los Altos de ChiapasSan Cristóbal de las Casas · Private | 661 | 170 | 105 | 1 |
| Instituto Universitario de Estudios ChiapasVenustiano Carranza · Private | 659 | 396 | 0 | 5 |
| Centro de Estudios Profesionales del GrijalvaPalenque · Private | 649 | 190 | 162 | 4 |
| Universidad del Pais InnovaTuxtla Gutiérrez · Private | 634 | 106 | 1 | 1 |
| Instituto Universitario de Estudios Mexico Plantel San CristobalOcosingo · Private | 569 | 122 | 114 | 5 |
| Escuela Normal Rural MactumactzaTuxtla Gutiérrez · Public | 563 | 118 | 108 | 1 |
| Universidad del Pacifico de ChiapasArriaga · Private | 550 | 185 | 171 | 4 |
| Escuela Bancaria y Comercial ChiapasTuxtla Gutiérrez · Private | 534 | 119 | 155 | 1 |
| Universidad Linda VistaPueblo Nuevo Solistahuacán · Private | 472 | 105 | 17 | 1 |
| Universidad San MarcosTuxtla Gutiérrez · Private | 466 | 134 | 88 | 1 |
| Escuela de EnfermeriaTuxtla Gutiérrez · Public | 437 | 132 | 103 | 1 |
| Universidad Pedagogica Nacional Unidad 071 TuxtlaTuxtla Gutiérrez · Public | 437 | 525 | 192 | 1 |
| Instituto Universitario de MexicoTapachula · Private | 424 | 238 | 154 | 1 |
| Escuela Normal Superior de ChiapasTuxtla Gutiérrez · Public | 417 | 161 | 161 | 1 |
| Escuela de Enfermeria TapachulaTapachula · Public | 412 | 75 | 44 | 1 |
| Centro Universitario Interamericano del PacificoTapachula · Private | 395 | 48 | 20 | 1 |
| Universidad Internacional del Conocimiento E InvestigacionTuxtla Gutiérrez · Private | 370 | 89 | 24 | 2 |
| Instituto de Formacion PolicialTuxtla Gutiérrez · Private | 363 | 55 | 35 | 1 |
| Instituto de Estudios de PosgradoTuxtla Gutiérrez · Public | 360 | 188 | 188 | 1 |
| Universidad del Sureste de MexicoPijijiapan · Private | 356 | 61 | 84 | 1 |
| Facultad Libre de Derecho de ChiapasTuxtla Gutiérrez · Private | 345 | 32 | 57 | 1 |
| Escuela Normal Indigena Intercultural Bilingue Jacinto CanekZinacantán · Public | 343 | 87 | 84 | 1 |
| Universidad del Valle de Mexico, Campus TuxtlaTuxtla Gutiérrez · Private | 342 | 195 | 139 | 1 |
| Universidad Pedagogica Nacional Unidad 072 TapachulaTapachula · Public | 323 | 169 | 190 | 1 |
| Centro Universitario San MarcosSan Cristóbal de las Casas · Private | 311 | 68 | 26 | 1 |
| Instituto Hispano Jaime SabinesTuxtla Gutiérrez · Private | 311 | 315 | 0 | 1 |
| Unidad Profesional Interdisciplinaria de Ingenieria Campus PalenquePalenque · Public | 310 | 0 | 0 | 1 |
| Centro de Estudios de Posgrado ChiapasTuxtla Gutiérrez · Private | 299 | 222 | 179 | 1 |
| Instituto de Estudios Universitarios GandhiComitán de Domínguez · Private | 294 | 113 | 113 | 1 |
| Universidad Latinoamericana de MexicoOcozocoautla de Espinosa · Private | 291 | 40 | 0 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores Miguel de Cervantes SaavedraTuxtla Gutiérrez · Private | 281 | 202 | 0 | 1 |
| Escuela Superior de TapachulaTapachula · Private | 263 | 179 | 55 | 2 |
| Centro de Estudios Superiores Benemerito de las AmericasOcozocoautla de Espinosa · Private | 258 | 38 | 43 | 1 |
| Instituto Tecnologico de Frontera ComalapaFrontera Comalapa · Public | 254 | 65 | 65 | 1 |
| Benemerita y Centenaria Escuela Normal de Licenciatura en Educacion Primaria del EstadoTuxtla Gutiérrez · Public | 253 | 72 | 122 | 1 |
| Escuela Normal de Licenciatura en Educacion Fisica Profr. Pedro Reynol Ozuna HenningTuxtla Gutiérrez · Public | 251 | 78 | 78 | 1 |
| Escuela Normal de Licenciatura en Educacion Primaria del EstadoTuxtla Gutiérrez · Public | 241 | 52 | 47 | 1 |
| Centro de Estudios Superiores FrailescaVillaflores · Private | 236 | 41 | 0 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores de MezcalapaCopainalá · Private | 236 | 55 | 77 | 1 |
| Instituto Profesional Educativo del SuresteTuxtla Gutiérrez · Private | 236 | 87 | 35 | 1 |
| Escuela Superior de Trabajo Social Jesus Aquino JuanTuxtla Gutiérrez · Public | 235 | 51 | 101 | 1 |
| Centro Academico Regional ChiapasCintalapa de Figueroa · Public | 230 | 30 | 26 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores AduanalesTapachula · Private | 227 | 74 | 39 | 1 |
| Centro de Estudios Universitarios de ChiapasSan Cristóbal de las Casas · Private | 225 | 33 | 56 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores las Aguilas Plantel las RosasLas Rosas · Private | 220 | 9 | 32 | 1 |
| Centro Universitario VillacarriedoArriaga · Private | 216 | 0 | 0 | 1 |
| El Colegio de la Frontera SurSan Cristóbal de las Casas · Public | 214 | 64 | 55 | 2 |
| Universidad de Ciencia y Tecnologia DescartesTuxtla Gutiérrez · Private | 212 | 44 | 3 | 1 |
| Escuela de Medicina AlternativaTuxtla Gutiérrez · Private | 205 | 21 | 14 | 1 |
| Colegio Universitario VersallesTuxtla Gutiérrez · Private | 202 | 48 | 49 | 4 |
| Escuela Normal Experimental Fray Matias Antonio de Cordova y OrdoñezSan Cristóbal de las Casas · Public | 199 | 50 | 48 | 1 |
| Escuela Normal Experimental la Enseñanza E Ignacio Manuel AltamiranoTuxtla Chico · Public | 199 | 49 | 49 | 1 |
| Escuela Normal de Licenciatura en Educacion Preescolar y Primaria del Estado TonalaTonalá · Public | 196 | 47 | 46 | 1 |
| Instituto Nacional de Estudios FiscalesTuxtla Gutiérrez · Private | 194 | 0 | 12 | 1 |
| Escuela Superior de Trabajo Social Jesus Aquino Juan Subsede TapachulaTuxtla Chico · Public | 192 | 51 | 51 | 1 |
| Escuela Normal de Licenciatura en Educacion Preescolar Rosaura Zapata CanoTuxtla Gutiérrez · Public | 191 | 69 | 69 | 1 |
| Escuela Normal de Licenciatura en Educacion Preescolar Bertha Von Glumer y LeyvaTuxtla Gutiérrez · Public | 186 | 68 | 69 | 1 |
| Universidad Interamericana para el Desarrollo Campus TapachulaTapachula · Private | 184 | 235 | 149 | 1 |
| Tecnológico Universitario TuxtlaTuxtla Gutiérrez · Private | 173 | 0 | 0 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores Frontera SurFrontera Comalapa · Private | 172 | 53 | 51 | 2 |
| Instituto de Administracion Publica del Estado de ChiapasTuxtla Gutiérrez · Private | 167 | 137 | 137 | 1 |
| Instituto Superior de Diseño de Modas ManiquieTuxtla Gutiérrez · Private | 165 | 11 | 16 | 1 |
| Universidad de los AngelesTuxtla Gutiérrez · Private | 165 | 51 | 0 | 1 |
| Escuela Normal de Licenciatura en Educacion Primaria y Especial Fray Matias de CordovaTapachula · Public | 163 | 51 | 51 | 1 |
| Universidad Cientifica E Idiomas de America LatinaSan Cristóbal de las Casas · Private | 162 | 34 | 33 | 1 |
| Instituto Superior LeuzagiPichucalco · Private | 161 | 62 | 51 | 1 |
| Instituto Latinoamericano de Estudios Profesionales de ChiapasJiquipilas · Private | 160 | 96 | 55 | 1 |
| Instituto Universitario PanamericanoTuxtla Gutiérrez · Private | 150 | 52 | 76 | 1 |
| Centro de Estudios en Artes Culinarias y EnologiaTuxtla Gutiérrez · Private | 146 | 54 | 21 | 1 |
| Universidad de BachajonChilón · Private | 143 | 26 | 57 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores ComitanComitán de Domínguez · Private | 139 | 54 | 0 | 1 |
| Escuela Normal de Licenciatura en Educacion Primaria Lic. Manuel LarrainzarSan Cristóbal de las Casas · Public | 136 | 69 | 62 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores del SurChiapa de Corzo · Private | 135 | 0 | 0 | 6 |
| Instituto Universitario de Ciencias en la Estetica HumanaVillaflores · Private | 135 | 68 | 0 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores Manuel Jose de RojasSan Cristóbal de las Casas · Private | 134 | 58 | 59 | 1 |
| Universidad Linda Vista Plantel Tuxtla GutierrezTuxtla Gutiérrez · Private | 131 | 27 | 44 | 1 |
| Universidad MeridionalSan Cristóbal de las Casas · Private | 124 | 24 | 27 | 1 |
| Escuela Normal de Licenciatura en Educacion Fisica de TapachulaTapachula · Public | 123 | 31 | 33 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores MetropolitanoVillaflores · Private | 122 | 49 | 8 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores Emilio Rabasa EstebanellSan Cristóbal de las Casas · Private | 118 | 55 | 36 | 1 |
| Centro Universitario del Valle de ChiapasTonalá · Private | 117 | 38 | 37 | 1 |
| Centro Universitario en Formacion ArtisticaTapachula · Private | 112 | 27 | 22 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores ÁgoraTuxtla Gutiérrez · Private | 112 | 0 | 0 | 1 |
| Instituto Metropolitano de ChiapasTuxtla Gutiérrez · Private | 110 | 0 | 0 | 1 |