| Universidad Autónoma del Estado de Quintana RooOthón P. Blanco · Public | 6,656 | 990 | 1,032 | 6 |
| Instituto Tecnologico de CancunBenito Juárez · Public | 4,052 | 580 | 369 | 1 |
| Universidad del CaribeBenito Juárez · Public | 4,020 | 658 | 568 | 1 |
| Universidad Anahuac de CancunBenito Juárez · Private | 3,943 | 543 | 428 | 1 |
| Instituto Tecnologico de ChetumalOthón P. Blanco · Public | 3,646 | 473 | 488 | 1 |
| Universidad Tecnologica de CancunBenito Juárez · Public | 3,424 | 1,289 | 932 | 1 |
| Universidad Interamericana para el DesarrolloBenito Juárez · Private | 2,420 | 484 | 241 | 4 |
| Tecnológico Universitario PlayacarSolidaridad · Private | 2,201 | 353 | 212 | 1 |
| Universidad Politecnica de Quintana RooBenito Juárez · Public | 1,760 | 194 | 284 | 1 |
| Humanitas Escuela de Estudios Superiores Plantel CancúnBenito Juárez · Private | 1,400 | 20 | 207 | 1 |
| Universidad Tecnologica de la Riviera MayaSolidaridad · Public | 1,319 | 271 | 89 | 1 |
| Javier Rojo GomezBacalar · Public | 1,240 | 317 | 176 | 2 |
| Universidad AztlanBenito Juárez · Private | 1,232 | 240 | 149 | 1 |
| Universidad RivieraSolidaridad · Private | 1,198 | 127 | 160 | 1 |
| Universidad la Salle CancunBenito Juárez · Private | 1,115 | 234 | 208 | 1 |
| Universidad MayaBenito Juárez · Private | 985 | 202 | 29 | 1 |
| Universidad Intercultural Maya de Quintana RooJosé María Morelos · Public | 899 | 41 | 0 | 1 |
| Universidad del Sur Plantel CancunBenito Juárez · Private | 873 | 276 | 114 | 2 |
| Instituto Tecnologico Superior de Felipe Carrillo PuertoFelipe Carrillo Puerto · Public | 815 | 252 | 0 | 1 |
| Universidad Americana de EuropaBenito Juárez · Private | 802 | 219 | 91 | 1 |
| Universidad de Oriente - CancúnBenito Juárez · Private | 787 | 126 | 172 | 1 |
| Universidad Vizcaya de las AmericasOthón P. Blanco · Private | 707 | 295 | 183 | 1 |
| Centro de Estudios Universitarios Vizcaya de las AméricasSolidaridad · Private | 682 | 66 | 0 | 1 |
| Universidad Tec Milenio CancunBenito Juárez · Private | 626 | 141 | 127 | 1 |
| Universidad Tecnológica de ChetumalOthón P. Blanco · Public | 542 | 203 | 166 | 1 |
| Universidad Pedagógica Nacional Unidad 231 ChetumalOthón P. Blanco · Public | 524 | 74 | 53 | 4 |
| Instituto Tecnologico de la Zona MayaOthón P. Blanco · Public | 504 | 83 | 133 | 1 |
| Universidad Politecnica de BacalarBacalar · Public | 449 | 84 | 87 | 1 |
| Universidad ModeloOthón P. Blanco · Private | 448 | 59 | 101 | 2 |
| HenbordBenito Juárez · Private | 446 | 105 | 0 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores Viktor FranklOthón P. Blanco · Private | 429 | 93 | 81 | 1 |
| Tecnológico Universitario CancúnBenito Juárez · Private | 390 | 105 | 43 | 1 |
| Centro Regional de Educacion NormalFelipe Carrillo Puerto · Public | 370 | 98 | 92 | 1 |
| Instituto Universitario de Alta Formación IuafBenito Juárez · Private | 341 | 66 | 2 | 1 |
| Centro Universitario InglesSolidaridad · Private | 334 | 45 | 47 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores para la Competitividad y el Desarrollo de AméricaOthón P. Blanco · Private | 324 | 134 | 74 | 1 |
| Universidad UnitechBenito Juárez · Private | 304 | 0 | 19 | 1 |
| Universidad Aztlán Campus Playa del CarmenSolidaridad · Private | 277 | 17 | 44 | 1 |
| Global Open UniversitySolidaridad · Private | 263 | 6 | 6 | 1 |
| Universidad UnimaatBenito Juárez · Private | 258 | 725 | 695 | 1 |
| Centro de Actualizacion del MagisterioOthón P. Blanco · Public | 244 | 62 | 57 | 1 |
| Universidad de Alto Rendimiento y EspecializaciónOthón P. Blanco · Private | 233 | 83 | 83 | 1 |
| Universidad SantanderBenito Juárez · Private | 226 | 60 | 0 | 1 |
| Instituto de Estudios Superiores LamatOthón P. Blanco · Private | 213 | 72 | 37 | 1 |
| Uciep, Consorcio EducativoBenito Juárez · Private | 200 | 0 | 0 | 1 |
| Universidad Latinoamericana del CaribeBenito Juárez · Private | 197 | 36 | 95 | 2 |
| Instituto Pericial JudicialBenito Juárez · Private | 191 | 31 | 31 | 1 |
| Centro de Estudios de Posgrado Campus CancúnBenito Juárez · Private | 189 | 55 | 85 | 1 |
| Instituto Universitario ItzamnáSolidaridad · Private | 189 | 70 | 0 | 1 |
| Universidad de Ciencias y Disciplinas de la Seguridad de Quintana RooOthón P. Blanco · Public | 189 | 0 | 0 | 1 |
| Filma Centro Universitario de Artes Visuales y EscénicasBenito Juárez · Private | 176 | 0 | 0 | 1 |
| Universidad Privada de la Peninsula Plantel Felipe Carrillo PuertoFelipe Carrillo Puerto · Private | 171 | 16 | 7 | 1 |
| Centro de Investigación Pedagógica del CaribeBenito Juárez · Private | 154 | 84 | 31 | 1 |
| Escuela Judicial del Poder Judicial del Estado de Quintana RooOthón P. Blanco · Public | 138 | 0 | 0 | 1 |
| Instituto de Educación Superior On Line CetecOthón P. Blanco · Private | 131 | 3 | 5 | 1 |
| Instituto Yucatán Península MisiónPuerto Morelos · Private | 119 | 30 | 19 | 1 |
| Andres Quintana RooBenito Juárez · Private | 110 | 12 | 11 | 1 |
| Universidad Partenon Cozumel, A.C.Cozumel · Private | 109 | 23 | 2 | 1 |